বরেন্দ্র গবেষণা জাদুঘরের শুরু বরেন্দ্র অনুসন্ধান সমিতি থেকে, যা ১৯১০ সালে প্রতিষ্ঠা করেন স্থানীয় পণ্ডিত ও পৃষ্ঠপোষকেরা — তাঁদের মধ্যে দিঘাপতিয়ার শরৎকুমার রায়, ইতিহাসবিদ অক্ষয়কুমার মৈত্রেয় ও প্রত্নতত্ত্ববিদ রমাপ্রসাদ চন্দ। হারিয়ে যাওয়ার আগে ভাস্কর্য ও শিলালিপি সংগ্রহ করতে তাঁরা প্রাচীন বরেন্দ্র অঞ্চল ঘুরে বেড়াতেন। এটি বাংলাদেশের প্রাচীনতম জাদুঘরগুলোর একটি, ১৯৬৪ সাল থেকে রাজশাহী বিশ্ববিদ্যালয় এর পরিচালনা করছে।
লাল ইটের ভবনটিতে আছে দেশের প্রাচীন বাংলার শিল্পকলার অন্যতম সেরা সংগ্রহ: পাল ও সেন যুগের হিন্দু ও বৌদ্ধ দেবদেবীর পাথর ও ব্রোঞ্জের মূর্তি, পোড়ামাটির ফলক, শিলালিপি, মুদ্রা ও পুরোনো পুঁথি, সঙ্গে পরবর্তী মুসলিম আমলের নিদর্শন।
জাদুঘরটি ছোট পরিসরের, আর অঞ্চলের প্রত্নস্থানগুলো দেখার আগে প্রস্তুতির সবচেয়ে ভালো জায়গা — অনেক ভাস্কর্যই এসেছে পাহাড়পুর ও মহাস্থানগড়ের মতো স্থান থেকে, যেগুলো পরে ঘুরে দেখতে পারেন।